瀨尾 悌介 （せお だいすけ） 助教 SEO Daisuke
所属組織・役職等
理工研究域 物質化学系
教育分野
【学士課程】
理工学域 物質化学類 化学コース
【大学院前期課程】
自然科学研究科 物質化学専攻
所属研究室等
生物化学 TEL:076-264-5683 FAX:076-264-5742
学歴
【出身大学院】
早稲田大学 博士課程 理工学研究科 物理学及応用物理学専攻 2002/03 修了
早稲田大学 修士課程 理工学研究科 物理学及応用物理学 1999/03 修了
【出身大学】
早稲田大学 教育学部 理学科生物学専修 1997/03 卒業
【取得学位】
博士(理学)
職歴
早稲田大学 教育学部 助手(2001/04/01-2003/11/30)
金沢大学 理学部(2003/12/01-)
生年月
1973年05月
所属学会
日本生化学会
日本植物生理学会
国際光合成学会
日本光合成学会
American Chemical Society
学内委員会委員等
受賞学術賞
専門分野
光化学反応中心 電子伝達、フラボ蛋白質 鉄硫黄蛋白質 シトクロム、生体関連化学、機能生物化学、生物物理学
専門分野キーワード
酸化還元酵素,鉄硫黄タンパク質,フラボ蛋白質,反応速度論,電子伝達系,光合成細菌,光化学反応中心,ストップトフロー法
研究課題
チオレドキシン還元酵素型Ferredoxin-NADPH酸化還元酵素の反応機構の解明
Ferredoxin-NADPH酸化還元酵素(FNR)は、鉄硫黄タンパク質FerredoxinとNAD(P)H間の酸化還元反応を触媒するフラボ酵素です。チオレドキシン還元酵素型FNRは、グラム陽性菌や緑色硫黄細菌などの多くの細菌で見出されるFNRで、近年その存在が明らかにされました。私たちは、同酵素の結晶構造情報に基づき、各種分光学的手法や分子生物学的手法を用いて多段階の電子伝達反応の速度論的解析を進め、フラボ酵素における構造-機能相関を明らかにすることを目指しています。
光合成細菌の鉄硫黄型光化学反応中心
緑色硫黄細菌は、末端電子受容体として鉄硫黄クラスターを有する光化学反応中心を持つ光合成細菌です。私たちは、同細菌の光学反応中心内の電子伝達反応や、同反応中心への電子供与系である無機硫黄化合物酸化経路、電子受容系であるNADP+光還元経路を構成する各種タンパク質の生化学的・分光学的・速度論的研究を行い、同細菌の光化学電子伝達経路の詳細を明らかにすることを目指しています。
Fd依存型酸化還元酵素の探索
生物は嫌気条件下においてFd依存型の酸化還元酵素を用い、炭酸同化、窒素固定、芳香族化合物の分解など様々な反応を行います。これらの酵素は精製が困難なものが多く、基質特異性や反応機構に関する研究は進んでいません。私たちは、これらのFd依存型酸化還元酵素の生化学的な性質を明らかにすることを目指しています。また、未知のFd依存型酵素の探索も行っています。
著書
論文
- Electron transfer kinetics in purified reaction centers from the green sulfur bacterium Chlorobium tepidum studied by multiple flash excitation Kusumoto N, (他2名), Seo D, Sakurai H BIOCHEMISTRY 38巻 12124-12137頁 1999 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
- Purification of ferredoxins and their reaction with purified reaction center complex from the green sulfur bacterium Chlorobium tepidum Seo D, (他4名), Sakurai H BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS 1503巻 377-384頁 2001 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
- Photoreduction and reoxidation of the three iron-sulfur clusters of reaction centers of green sulfur bacteria Sétif P, Seo D, Sakurai H BIOPHYSICAL JOURNAL 81巻 1208-1219頁 2001 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
- Kinetics of electron transfer between soluble cytochrome c-554 and purified reaction center complex from the green sulfur bacterium Chlorobium tepidum Itoh T, Seo D, Setif P, Sakurai H PHOTOSYNTHESIS RESEARCH 71巻 121-125頁 2002 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
- Purification and characterization of ferredoxin-NAD(P)+ reductase from the green sulfur bacterium Chlorobium tepidum Seo D, Sakurai H BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEIN STRUCTURE AND MOLECULAR ENZYMOLOGY 1597巻 123-132頁 2002 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
- Time-resolved step-scan FTIR investigation on the primary donor of the reaction center from the green sulfur bacterium Chlorobium tepidum Mezzetti A, Seo D, (他3名) PHOTOSYNTHESIS RESEARCH 75巻 161-169頁 2003 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
- Purification and characterization of ferredoxin-NADP(+) reductase encoded by Bacillus subtilis yumC Seo D, Kamino K, Inoue K, Sakurai H. ARCHIVES OF MICROBIOLOGY 182巻 1号 80-89頁 2004/09 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
- Diverse NO reduction by Halomonas halodenitrificans nitric oxide reductase Takeshi Sakurai,(他2名), Daisuke Seo,(他1名) BIOCHEM. BIOPHY. RES. COM. 333巻 483-487頁 2005 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
- Crystallization and preliminary X-ray studies of ferredoxin-NAD(P)+ reductase from Chlorobium tepidum. Ｍｕｒａｋｉ Ｎ，Ｓｅｏ Ｄ，Ｓｈｉｂａ Ｔ， Ｓａｋｕｒａｉ Ｔ，Ｋｕｒｉｓｕ Ｇ． Acta Crystallogr. Sect. F Struct. Biol. Cryst. Commun. 64巻 3号 186-189頁 2008/03 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
- Structure and function of the engineered multicopper oxidase CueO from Escherichia coli--deletion of the methionine-rich helical region covering the substrate-binding site. 373巻 1号 141-152頁 2007/10 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
- SoxAX binding protein, a novel component of the thiosulfate oxidizing multi-enzyme system in the green sulfur bacterium Chlorobium tepidum. 190巻 18号 6097-6110頁 2008/09 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
- Studies of interaction of homo-dimeric ferredoxin-NAD(P)+ oxidoreductases of Bacillus subtilis and Rhodopseudomonas palustris, that are closely related to thioredoxin reductases in amino acid sequence, with ferredoxins and pyridine nucleotide coenzymes. 1794巻 4号 594-601頁 2009/04 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
- Four-electron reduction of dioxygen by a multicopper oxidase, CueO, and roles of Asp112 and Glu506 located adjacent to the trinuclear copper center. 284巻 21号 14405-14413頁 2009/03 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
- Crystallization and preliminary X-ray studies of ferredoxin-NADP+ oxidoreductase encoded by Bacillus subtilis yumC. 2010/04 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
- Biochemical studies of a soxF-encoded monomeric flavoprotein purified from the green sulfur bacterium Chlorobaculum tepidum that stimulates in vitro thiosulfate oxidation. 2010/04 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
- Asymmetric dimeric structure of ferredoxin-NAD(P)+ oxidoreductase from the green sulfur bacterium Chlorobaculum tepidum: implications for binding ferredoxin and NADP+. 2010/09 査読有 原著論文
- Crystal structure analysis of Bacillus subtilis ferredoxin-NADP+ oxidoreductase and the structural basis for its substrate selectivity. Komori H, Seo D, Sakurai T, Higuchi Y 19巻 2279-2290頁 2010/12 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
- Document Role of the C-terminal extension stacked on the re-face of the isoalloxazine ring moiety of the flavin adenine dinucleotide prosthetic group in ferredoxin-NADP+ oxidoreductase from Bacillus subtilis Seo, D., Asano, T., Komori, H., Sakurai, T. Plant Physiology and Biochemistry 81巻 143-148頁 2014/08 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
- Replacement of Tyr50 stacked on the si-face of the isoalloxazine ring of the flavin adenine dinucleotide prosthetic group modulates Bacillus subtilis ferredoxin-NADP+ oxidoreductase activity toward NADPH Seo, D., Naito, H., Nishimura, E., Sakurai, T. Photosynthesis Research 125巻 1-2号 321-328頁 2015/02 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
- Pre-steady-state kinetic studies of redox reactions catalysed by Bacillus subtilis ferredoxin-NADP+ oxidoreductase with NADP+/NADPH and ferredoxin Seo, D., Soeta, T., Sakurai, H., Sétif, P., Sakurai, T. Biochimica et Biophysica Acta - Bioenergetics 1857巻 6号 678-687頁 2016/06 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
- Kinetics of NADP+/NADPH reduction–oxidation catalyzed by the ferredoxin-NAD(P)+ reductase from the green sulfur bacterium Chlorobaculum tepidum Seo, D., Kitashima, M., Sakurai, T., Inoue, K. Photosynthesis Research 2016/07 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
- Heterologous expression of Halomonas halodenitrificans nitric oxide reductase and its N-terminally truncated NorC subunit in Escherichia coli Sakurai N, Kataoka K, Sugaya N, Shimodaira T, Iwamoto M, Shoda M, Horiuchi H, Kiyono M, Ohta Y, Triwiyono B, Seo D, Sakurai T Journal of Inorganic Biochemistry 169巻 1号 61-67頁 2017/01 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
- C-terminal residues of ferredoxin-NAD(P)+ reductase from Chlorobaculum tepidum are responsible for reaction dynamics in the hydride transfer and redox equilibria with NADP+/NADPH 瀬尾悌介、浅野智哉 Photosynthesis Research 2018/06 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
- Kinetic and structural insight into a role of the re-face Tyr328 residue of the homodimer type ferredoxin-NADP+ oxidoreductase from Rhodopseudomonas palustris in the reaction with NADP+/NADPH 瀬尾悌介、村木則文、栗栖源嗣 Biochimica et Biophysica Acta-Bioenergetics 1861巻 3号 2020/03/01 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
- Rubredoxin from the green sulfur bacterium Chlorobaculum tepidum donates a redox equivalent to the flavodiiron protein in an NAD(P)H dependent manner via ferredoxin-NAD(P)+ oxidoreductase Wanwipa Ittarat, Takeshi Sato, Masaharu Kitashima, Hidehiro Sakurai, Kazuhito Inoue, Daisuke Seo* Archives of Microbiology 203巻 799-808頁 2021/03/01 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
- Characterization of light-induced short-lived interacting radicals in the active site of flavoprotein ferredoxin-NADP+ oxidoreductase Bo Zhuang, Daisuke Seo, Alexey Aleksandrov, Marten H. Vos Journal of American Chemical Society 143巻 2757-2768頁 2021/02/24 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
- Thioredoxin Reductase-Type Ferredoxin: NADP+ Oxidoreductase of Rhodopseudomonas palustris: Potentiometric Characteristics and Reactions with Nonphysiological Oxidants Mindaugas Lesanavičius,Daisuke Seo,Narimantas Čėnas Antioxidants 11巻 5号 1頁 2022/05 査読有 研究論文（学術雑誌）
- Excited-State Properties of Fully Reduced Flavins in Ferredoxin-NADP+ Oxidoreductase Bo Zhuang, Alexey Aleksandrov, Daisuke Seo, Marten H Vos Jornal of Physical Chemistry Letter 14巻 1096-1102頁 2023/01/26 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
- The Role of the si-Face Tyrosine of a Homodimeric Ferredoxin-NADP+ Oxidoreductase from Bacillus subtilis during Complex Formation and Redox Equivalent Transfer with NADP+/H and Ferredoxin. Daisuke Seo Antioxidants 12巻 9号 1741頁 2023/09/08 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
講演・口頭発表等
その他（報告書など）
芸術・フィールドワーク
特許
共同研究希望テーマ
科研費
○基盤研究(C)（一般）「 酵素基質複合体の構造ダイナミクス解析に基づく反応方向制御機構の解明」(2017-2019) 代表者
競争的資金・寄付金等
○助成金 (2009-2009) 研究 枯草菌laccase発現系の構築と酵素活性の評価 タカノ農芸化学研究助成財団
○助成金 (2011-2011) 研究 ウルシラッカーゼ代替酵素の探索 山本文二郎漆科学研究助成 京都市産業
○助成金 (2004-2004) 研究 光合成細菌のNADP+光還元機構の解明（国際研究集会旅費） 井上科学振興財団
○助成金 (2006-2006) 研究 Biochemical properties and reaction mechanism of Chlorobium type ferredoxin-NADPH oxidoreductase（国際交流（研究集会）援助） ライフサイエンス振興財団
共同研究・受託研究実績
A-STEP採択課題
学域・学類担当授業科目
○物質化学実験Ａ(2022)
○物質化学実験Ｃ(2022)
○物質化学実験Ｃ(2022)
○物質化学実験Ａ(2022)
○データサイエンス基礎(2022)
○データサイエンス基礎(2021)
○物質化学実験Ｃ(2021)
○データサイエンス基礎(2020)
○物質化学実験Ａ(2020)
○物質化学実験Ｃ(2020)
○情報処理基礎(2019)
○物質化学実験Ｃ(2019)
○物質化学実験C(2019)
○情報処理基礎(2019)
○物質化学実験Ｃ(2018)
○情報処理基礎(2018)
○物質化学実験Ｃ(2017)
○情報処理基礎(2017)
○情報処理基礎(2016)
○物質化学実験Ｃ(2016)
○物質化学実験Ｃ(2015)
○情報処理基礎(2015)
○情報処理基礎(2014)
○物質化学実験Ｃ(2014)
大学院担当授業科目
○物質創成セミナー(2021)
○物質創成セミナー(2020)
○物質創成セミナー(2020)
○物質創成セミナー(2019)
○物質創成セミナー(2019)
○物質創成セミナー(2018)
○物質創成セミナー平成２９年度入学生用(2017)
○物質創成セミナー平成２９年１０月入学者用(2017)
○物質創成セミナー平成２８年度入学生用(2016)
○物質創成セミナー平成２８年１０月入学者用(2016)
○物質創成セミナー平成２７年１０月入学者用(2015)
○物質創成セミナー平成２７年度入学生用(2015)
○物質創成セミナー平成２６年１０月入学者用(2014)
○物質創成セミナー平成２６年度入学生用(2014)