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研究者情報

データ更新日:2017年05月23日

堀家 慎一 (ほりけ しんいち) 准教授 HORIKE Shin-ichi

メール 研究室ウェブサイト

所属組織・役職等

学際科学実験センター ゲノム機能解析分野
准教授

教育分野

【学士課程】
医薬保健学域 医学類 動物実験と再生医学
【大学院前期課程】
医薬保健学総合研究科
【大学院後期課程】
連合大学院小児発達学研究科 協調運動障害学研究領域

所属研究室等

堀家研究室 TEL:076-265-2775 FAX:076-234-4537

学歴

【出身大学院】
鳥取大学 博士課程 医学系研究科 生命科学 2000/09 修了
島根大学 修士課程 理学研究科 化学専攻 1997/03 修了
【出身大学】
島根大学 理学部 化学科 1995/03 卒業
【取得学位】
医学(生命科学)博士

職歴

鳥取大学 博士研究員(2000/10/01-2001/07/14)
(米)ローレンスバークレイ国立研究所 博士研究員(2001/07/15-2004/06/30)
(加)トロント小児病院 博士研究員(2004/07/01-2006/09/30)
徳島大学 疾患酵素学研究センター 助教(2006/10/01-2007/10/31)
金沢大学 フロンティアサイエンス機構(2007/11/01-2012/03/31)

生年月

1972年12月

所属学会

日本分子生物学会
日本エピジェネティクス研究会
日本人類遺伝学会
The American Society of Human Genetics in USA
International Society for Autism Research
日本生化学会
RNA学会
日本遺伝学会

学内委員会委員等

○遺伝子組換え実験安全委員会 委員(2014-)
○教育研究推進専門委員会 委員(2012-)
○ヒトゲノム・遺伝子解析研究倫理審査委員会 委員(2012-)
○臨床研究利益相反マネージメント委員会 委員(2012-)

受賞学術賞

専門分野

エピジェネティクス

専門分野キーワード

インプリンティング、エピジェネティクス、自閉症、レット症候群、

研究課題

染色体工学技術を用いた自閉症羅患遺伝子座の解析

15q11-q13刷り込み遺伝子領域のクロマチン動態の解析

PEG1/MEST刷り込み領域の遺伝子発現制御機構の解明

オキシトシンレセプター遺伝子の発現制御機構の解明

著書

  • ノンコーディングRNAテキストブック 羊土社 2015/12/10 共著 目黒牧子,堀家慎一 978-4-7581-0351-0
  • ノンコーディングRNA RNA分子の全体像を俯瞰する 化学同人 2016/07/15 共著 目黒牧子,堀家慎一 978-4-7598-1725-6
  • エピジェネティクスの産業応用 シーエムシー出版 2014/04 原著書 分担執筆 目黒牧子,堀家慎一 978-4-7813-0933-0
  • 自閉症分子マーカー探索—自閉症の遺伝子・分子生物・実験動物学的研究 医歯薬出版株式会社 2009/12 原著書 共著 東田陽博,堀家慎一,小泉恵太,吉原亨
  • Epigenetic defects related to assisted reproductive technologies: Large offspring syndrome (LOS) 2012/03 原著書 共著 978-953-51-0320-2

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  • [How the methyl-CpG binding protein-related epigenetic disease turns on the genes that produce its symptoms]. 50巻 8号 978-84頁

論文

  • 15q11.2-13.3 chromatin analysis reveals epigenetic regulation of CHRNA7 with deficiencies in Rett and autism brain. Yasui DH,Scoles HA,Horike S,Meguro-Horike M,Dunaway KW,Schroeder DI,Lasalle JM Hum Mol Genet 20巻 22号 4311-23頁 原著論文 研究論文(学術雑誌)
  • Neuron-specific impairment of inter-chromosomal pairing and transcription in a novel model of human 15q-duplication syndrome. Meguro-Horike M,Yasui DH,Powell W,Schroeder DI,Oshimura M,Lasalle JM,Horike S Hum Mol Genet 20巻 19号 3798-810頁
  • Aberrant CpG methylation of the imprinting control region KvDMR1 detected in assisted reproductive technology-produced calves and pathogenesis of large offspring syndrome. Hori N,Nagai M,Hirayama M,Hirai T,Matsuda K,Hayashi M,Tanaka T,Ozawa T,Horike S Anim Reprod Sci 122巻 3-4号 303-12頁
  • Localization of an hTERT repressor region on human chromosome 3p21.3 using chromosome engineering. Abe S,Tanaka H,Notsu T,Horike S,Fujisaki C,Qi DL,Ohhira T,Gilley D,Oshimura M,Kugoh H Genome Integr 1巻 1号 6頁
  • Screening of DNA methylation at the H19 promoter or the distal region of its ICR1 ensures efficient detection of chromosome 11p15 epimutations in Russell-Silver syndrome. Horike S,Ferreira JC,Meguro-Horike M,Choufani S,Smith AC,Shuman C,Meschino W,Chitayat D,Zackai E,Scherer SW,Weksberg R Am J Med Genet A 149A巻 11号 2415-23頁

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  • A translocation t(6;7)(p11-p12;q22) associated with autism and mental retardation: localization and identification of candidate genes at the breakpoints. Vincent JB,Choufani S,Horike S,Stachowiak B,Li M,Dill FJ,Marshall C,Hrynchak M,Pewsey E,Ukadike KC,Friedman JM,Srivastava AK,Scherer SW Psychiatr Genet 18巻 3号 101-9頁
  • DLX5 expression is monoallelic and Dlx5 is up-regulated in the Mecp2-null frontal cortex. Miyano M,Horike S,Cai S,Oshimura M,Kohwi-Shigematsu T J Cell Mol Med 12巻 4号 1188-91頁
  • An inversion inv(4)(p12-p15.3) in autistic siblings implicates the 4p GABA receptor gene cluster. Vincent JB,Horike SI,Choufani S,Paterson AD,Roberts W,Szatmari P,Weksberg R,Fernandez B,Scherer SW J Med Genet 43巻 5号 429-34頁
  • Loss of silent-chromatin looping and impaired imprinting of DLX5 in Rett syndrome. Horike S,Cai S,Miyano M,Cheng JF,Kohwi-Shigematsu T Nat Genet 37巻 1号 31-40頁
  • Construction of a novel human artificial chromosome vector for gene delivery. Katoh M,Ayabe F,Norikane S,Okada T,Masumoto H,Horike S,Shirayoshi Y,Oshimura M Biochem Biophys Res Commun 321巻 2号 280-90頁
  • Targeted disruption of the human LIT1 locus defines a putative imprinting control element playing an essential role in Beckwith-Wiedemann syndrome. Horike S,Mitsuya K,Meguro M,Kotobuki N,Kashiwagi A,Notsu T,Schulz TC,Shirayoshi Y,Oshimura M Hum Mol Genet 9巻 14号 2075-83頁
  • FunctionalInvestigation of a Non-coding Variant Associated with Adolescent Idiopathic Scoliosis in Zebrafish: Elevated Expression of the Ladybird Homeobox Gene Causes Body Axis Deformation. 12巻 1号 2016 査読有 原著論文 研究論文(学術雑誌)
  • Oxytocin for Male Subjects with Autism Spectrum Disorder and Comorbid Intellectual Disabilities: A Randomized Pilot Study. 7:2巻 2016 査読有 研究論文(学術雑誌)
  • Pancreatic solitary fibrous tumor causing ectopic adrenocorticotropic hormone syndrome. 436巻 268-273頁 2016 査読有 原著論文 研究論文(学術雑誌)
  • Cumulative impact of large chromosomal duplications and polychlorinated biphenyl exposure on DNA methylation, chromatin, and expression of autism candidate gene Cell Reports 2016/10/27 査読有 原著論文 研究論文(学術雑誌)

講演・口頭発表等

  • “A noncoding imprinted RNA, MESTIT1 is essential for the repression in cis of KLF14” 62th Annual Meeting; The American Society of Human Genetics, Nov. 6-Nov. 10, 2012, San Francisco, USA.(2012)
  • “A novel model of human 15q-duplication syndrome: neuron-specific impairment of inter-chromosomal pairing and transcription” Cell Symposia: Autism Spectrum Disorders: From Mechanisms to Therapies, Nov. 9-Nov. 11, 2011, Arlington, USA.(2011)
  • “Neuron-specific impairment of inter-chromosomal pairing and transcription in a novel model of human 15q-duplication syndrome” 12th International Congress of Human Genetics and 61th Annual Meeting; The American Society of Human Genetics, Oct. 11-Oct. 15, 2011, Montreal, Canada.(2011)
  • “Higher order inter-chromosomal association of maternal and paternal alleles of 15q11-q13” ICC on Genomic Imprinting and Beyond, Sep. 21- Sep. 23, 2011, Barcelona, Spain.(2011)
  • “MeCP2- and CTCF-mediated homologous 15q11-q13 pairing is essential for neuronal gene expressions.” Keystone symposia, Environmental Epigenomics and Disease Susceptibility, March 27-April 1, 2011, Asheville, USA.(2010)

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  • “Homologous pairing of chromosome 15q11-q13 is associated with significant disruption of gene expression in human maternal chromosome 15 microcell transferred neurons.” A Brain Research Meeting; The Emerging Neuroscience of Autism Spectrum Disorders, Nov. 11-Nov. 12, 2010, San Diego, USA.(2010)
  • “Homologous pairing of chromosome 15q11-q13 is associated with significant disruption of gene expression in human maternal chromosome 15 microcell transferred neurons.” 60th Annual Meeting; The American Society of Human Genetics, Nov. 2-Nov. 6, 2010, Washington DC, USA.(2010)
  • “Homologous pairing of chromosome 15q11-q13 is associated with significant disruption of gene expression in human maternal chromosome 15 microcell transferred neurons.” Epigenetics Europe, Sep. 14-Sep. 15, 2010, Dublin, Ireland.(2010)
  • “Homologous pairing of chromosome 15q11-q13 is associated with significant disruption of gene expression in human maternal chromosome 15 microcell transferred neurons.” Wellcome Trust Scientific Conferences; Signalling to Chromatin, Sep. 7-Sep. 10, 2010, Cambridge, UK.(2010)
  • “Homologous pairing of chromosome 15q11-q13 is associated with significant disruption of gene expression in human maternal chromosome 15 microcell transferred neurons.” Sweden-Japan Joint Colloquium, Sep. 6-Sep. 7, 2010, Stockholm, Sweden.(2010)
  • “Homologous pairing of chromosome 15q11-q13 is associated with significant disruption of gene expression in human maternal chromosome 15 microcell transferred neurons.” The 9th Annual International Meeting for Autism Research, May 20-May 22, 2010, Philadelphia, USA.(2010)
  • “An animal model for 15q dup syndrome” Dup 15q Research Meeting, May 19, 2010, Philadelphia, USA.(2010)
  • “Characterization of regulatory sequences essential for homologous pairing of chromosome 15q11-q13.” 59th Annual Meeting; The American Society of Human Genetics, Oct. 20-Oct. 24, 2009, Honolulu, USA.(2009)
  • “Characterization of regulatory sequences essential for homologous pairing of chromosome 15q11-q13.” 18th Lake Shirakaba Conference, June 20-June 21, 2009, Vedbaek, Denmark.(2009)
  • 「広汎性神経発達障害に関連する15q11-q13ゲノム刷り込み領域のアレル特異的クロマチンダイナミクスの解析」日本人類遺伝学会第57回大会,京王プラザホテル,東京,2012年10月24日〜27日(2012)
  • 「PEG1/MEST遺伝子領域のゲノム刷り込み制御機構の解明」第6回日本エピジェネティクス研究会年会,学術総合センター,東京,2012年5月14日〜15日(2012)
  • 「Neuron-specific inter-chromosomal pairing and transcription at the GABAaR subunit genes cluster」第34回日本分子生物学会年会,パシフィコ横浜,横浜,2011年12月13日〜16日(2011)
  • 「ヒト15q11-q13領域におけるアレル特異的クロマチン脱凝集の解析」日本分子生物学会 第11回春季シンポジウム,石川県立音楽堂 金沢,2011年5月25日〜26日(2011)
  • ヒト15q11-q13領域におけるアレル特異的クロマチン脱凝集の解析」第5回日本エピジェネティクス研究会年会,KKRホテル熊本,熊本,2011年5月19日〜20日(2011)
  • 「Acquisition of a germline methylation imprint at the SNRPN DMR」International Symposium on Epigenome Network, Development and Reprogramming of Germ Cells,九州大学医学部 百年講堂,福岡,2010年11月22日〜24日(2010)
  • 「母方15番染色体重複細胞株における15q11-q13領域の遺伝子発現および染色体ペアリングの解析」第4回日本エピジェネティクス研究会年会,米子市文化ホール,米子,2010年5月28日〜29日(2010)
  • 「Epigenetics in Autism Research」International Conference on Social Brain: Autism and Neuroethics,金沢,2010年3月24日〜25日(2009)
  • 「Homologous pairing of chromosome 15q11-q13 is associated with significant disruption of gene expression in human maternal chromosome 15 microcell transferred neurons」日本人類遺伝学会第55回大会,大宮ソニックシティ,さいたま市,2010年10月27日〜30日(2010)
  • 「Homologous pairing of chromosome 15q11-q13 is associated with significant disruption of gene expression within the paired region」第32回日本分子生物学会年会,パシフィコ横浜,横浜,2009年12月9日〜12日(2009)
  • 「ヒト染色体工学を用いた15q11-13の染色体ペアリングの解析」第3回日本エピジェネティクス研究会年会,学術総合センター,東京,2009年5月22日〜23日(2009)

芸術・フィールドワーク

特許

共同研究希望テーマ

科研費

○若手研究(B)「15q11-13染色体ペアリングに着目した自閉症発症機構の解明」(2009-2010) 代表者
○新学術領域研究(研究領域提案型)「核マトリックスを介した長鎖ncRNA,UBE3A-ATSのクロマチン制御機構」(2010-2011) 代表者
○特定領域研究「ヒトDMRにおける母性メチル化インプリント確立メカニズムの解明」(2011-2012) 代表者
○若手研究(B)「染色体の空間的配置と組織特異的遺伝子発現制御機構の解明」(2011-2012) 代表者
○新学術領域研究(公募)「インプリント長鎖非コードRNAの核内動態とクロマチンダイナミクスの解析」(2012-2013) 代表者
○基盤研究(C)「神経細胞特異的なクロマチンダイナミクスを司る分子の同定」(2013-2015) 代表者
○基盤研究(C)「エピジェネティック因子MBD5による発達障害発症機序の解明」(2014-2016) 分担者
○新学術領域研究(公募)「核内足場クロマチン構造を介したncRNA, IPWの作動機序の解明」(2015-2016) 代表者
○基盤研究(C)「LINE1配列のストランド特異的分布とMARを介したクロマチン制御機構の解明」(2016-2018) 代表者
○厚生科研「レット症候群の早期診断と治療を目指した統合的研究」(2013-) 分担者
○厚生科研「レット症候群の診断と予防・治療法確立のための臨床および生物科学の集学的研究」(2009-2011) 分担者

学域・学類担当授業科目

大学院担当授業科目

○動物実験学演習(2017)
○学際センターセミナー(2017)
○遺伝子工学基礎技術コース(2017)
○動物実験学演習(2016)

他大学の客員教授

教育活動(FD)に関する研究

国際事業協力

留学生参加の社会活動

審議会等の参加

講演可能なテーマ

○ヒト染色体工学
○自閉症の遺伝学
○エピジェネティクス

その他公的社会活動

○富山県高教研化学部会(20160927-20160927) 富山県立富山中部高校にて,高校化学担当教員約100名に対し,「ジェネティクスとエピジェネティクス」の演題で講演を行った。
○日本学術振興会(20160729-20160729) JSPSの委託事業として小学生向けのプログラム「ひらめきときめきサイエンス」を執り行う。本年度は、近隣の小学生22名に対し、染色体とは何かについて、優しく実習・講義を行った。
○日本学術振興会(20150731-20150731) JSPSの委託事業として小学生向けのプログラム「ひらめきときめきサイエンス」を執り行う。本年度は、近隣の小学生26名に対し、染色体とは何かについて、優しく実習・講義を行った。
○日本学術振興会(20140801-20140801) JSPSの委託事業として小学生向けのプログラム「ひらめきときめきサイエンス」を執り行う。本年度は、近隣の小学生27名に対し、染色体とは何かについて、優しく実習・講義を行った。
○日本学術振興会(20130730-20130730) JSPSの委託事業として小学生向けのプログラム「ひらめきときめきサイエンス」を執り行う。本年度は、近隣の小学生25名に対し、染色体とは何かについて、優しく実習・講義を行った。

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