データ更新日：2024年03月22日
FLECHSIG HOLGER （ふれくしぐ ほるがー） 特任助教 FLECHSIG, Holger
所属組織・役職等
ナノ生命科学研究所
教育分野
所属研究室等
学歴
職歴
お茶の水女子大学 情報科学科 研究者(2017/11/01-2018/01/31)
広島大学 大学院理学研究科・理学部 研究者(2017/04/01-2018/01/31)
広島大学 大学院理学研究科・理学部 助教(2015/04/01-2017/03/31)
広島大学 大学院理学研究科・理学部 研究者(2014/02/01-2015/03/31)
Fritz Haber Institute of the Max Planck Society Department of Physical Chemistry Postdoc(2011/12/01-2014/01/31)
生年月
所属学会
学内委員会委員等
受賞学術賞
専門分野
生物物理学
専門分野キーワード
理論生物物理, 計算生物物理
研究課題
著書
- Molecular Motors - Nanoscale engines of the cell and their structurally resolved modeling. VHS Publishing 2012 原著書 単著 H. Flechsig 978-3838134086
論文
- Dynamics of Target DNA Binding and Cleavage by Staphylococcus aureus Cas9 as Revealed by High-Speed Atomic Force Microscopy Leonardo Puppulin, Junichiro Ishikawa, Ayumi Sumino, Arin Marchesi, Holger Flechsig, Kenichi Umeda, Noriyuki Kodera, Hiroshi Nishimasu, Mikihiro Shibata ACS Nano 2023/02/27 査読有 原著論文
- BioAFMviewer software for simulation atomic force microscopy of molecular structures and conformational dynamics Romain Amyot, Noriyuki Kodera, Holger Flechsig Journal of Structural Biology: X 100086頁 2023/02/13 査読有 総説
- Biophysical Reviews Issue Focus call: Computational biophysics of atomic force microscopy Takashi Sumikama, Damien Hall, Holger Flechsig Biophysical Reviews 2023/02/01 査読有 解説
- Importance of annexin V N-terminus for 2D crystal formation and quick purification protocol of recombinant annexin V Ryusei Yamada, Tran Ngoc Trang, Holger Flechsig, Toshiki Takeda, Noriyuki Kodera, Hiroki Konno PLoS ONE e0278553頁 2022/12/22 査読有 原著論文
- Novel DNA aptamer for CYP24A1 inhibition with enhanced antiproliferative activity in cancer cells. Madhu Biyani, Kaori Yasuda, Yasuhiro Isogai, Yuki Okamoto, Wei Weilin, Noriyuki Kodera, Holger Flechsig, Toshiyuki Sakaki, Miki Nakajima, Manish Biyani ACS Appl. Mater. Interfaces 14巻 16号 18064-18078頁 2022 査読有 原著論文
- Simulation atomic force microscopy for atomic reconstruction of biomolecular structures from resolution-limited
experimental images. Romain Amyot, Arin Marchesi, Clemens M Franz, Ignacio Casuso, Holger Flechsig PLoS Comput. Biol. 18巻 3号 e1009970頁 2022 査読有 原著論文
- An ultra-wide scanner for large-area high-speed atomic force microscopy with megapixel resolution. Arin Marchesi, Kenichi Umeda, Takumi Komekawa, Takeru Matsubara, Holger Flechsig, Toshio Ando, Shinji Watanabe, Noriyuki Kodera, Clemens M Franz Scientific Reports 11巻 13003頁 2021 査読有 原著論文
- BioAFMviewer: An interactive interface for simulated AFM scanning of biomolecular structures and dynamics R. Amyot, H. Flechsig PLoS Comput. Biol. 16巻 11号 e1008444頁 2020 査読有 原著論文
- Allosteric communication in molecular machines via information exchange: what can be learned from dynamical modeling. D. Loutchko, H. Flechsig Biophys. Rev. 2020 査読有 総説
- Simple mechanics of protein machines H. Flechsig, A.S. Mikhailov J. R. Soc. Interface 16巻 155号 20190244頁 2019 査読有 総説
- Analyzing Fluctuation Properties in Protein Elastic Networks with Sequence-Specific and Distance-Dependent Interactions R. Amyot, Y. Togashi, H. Flechsig Biomolecules 9巻 10号 549頁 2019 査読有 原著論文 研究論文（学術雑誌）
- Designed Elastic Networks: Models of Complex Protein Machinery H. Flechsig, Y. Togashi Int. J. Mol. Sci. 19巻 10号 3152頁 2018 査読有 総説
- Coarse-Grained Protein Dynamics Studies Using Elastic Network Models Y. Togashi, H. Flechsig Int. J. Mol. Sci. 19巻 12号 3899頁 2018 査読有 総説
- Design of elastic networks with evolutionary optimized long-range communication as mechanical models of allosteric proteins. H. Flechsig Biophys. J. 113巻 558-571頁 2017 査読有 原著論文
- Deciphering intrinsic inter-subunit couplings that lead to sequential hydrolysis of F1-ATPase ring. L. Dai, H. Flechsig, J. Yu Biophys. J. 113巻 1440-1453頁 2017 査読有 原著論文
- Non-RVD mutations that enhance the dynamics of the TAL repeat array along the superhelical axis improve TALEN genome editing efficacy. N. Tochio, K. Umehara, J. Uewaki, H. Flechsig, M. Kondo, T. Dewa, T. Sakuma, T. Yamamoto, T. Saitoh, Y. Togashi, S. Tate Scientific Reports 6巻 37887頁 2016 査読有 原著論文
- Towards synthetic molecular motors: a model elastic-network study. A. Sarkar, H. Flechsig, A.S. Mikhailov New J. Phys. 18巻 043006頁 2016 査読有 原著論文
- Nucleotide-induced conformational dynamics in ABC transporters from structure-based coarse grained modelling. H. Flechsig Front. Phys. 4巻 3頁 2016 査読有 原著論文
- TALEs from a spring - superelasticity of Tal effector protein structures. H. Flechsig PLoS ONE 9巻 10号 e109919頁 2014 査読有 原著論文
- In silico investigation of conformational motions in superfamily 2 helicase proteins. H. Flechsig, D. Popp, A.S. Mikhailov PLoS ONE 6巻 7号 e21809頁 2011 査読有 原著論文
- Tracing entire operation cycles of molecular motor hepatitis C virus helicase in structurally resolved dynamical simulations. H. Flechsig, A.S. Mikhailov Proc. Natl. Acad. Sci. USA 107巻 20875-20880頁 2010 査読有 原著論文
- Computational biology approach to uncover hepatitis C virus helicase operation. H. Flechsig W. J. Gastroenterol. 20巻 3401-3409頁 2014 査読有 総説
- On the spectral gap in Andreev graphs. H. Flechsig, S. Gnutzmann Proc. Symp. Pure Math 77巻 381-395頁 2008 査読有 原著論文
- Elastic network modeling of molecular motor HCV helicase: Inchworm translocation and DNA unzipping cycles. H. Flechsig, A.S. Mikhailov Dynamics Days Europe 2009 (Network and Time Series 6 pp 11) 6巻 11頁 2009 査読有 原著論文
- Structurally Resolved Coarse-Grained Modeling of Motor Protein Dynamics H. Flechsig 2012 査読有 原著論文
- Gap-Statistics in Andreev-Graphs H. Flechsig 2006 査読有 原著論文
講演・口頭発表等
その他（報告書など）
芸術・フィールドワーク
特許
共同研究希望テーマ
科研費
○生物物理 「アロステリック制御を実現するタンパク構造の設計原理」(2016-2020) 分担者
○生物物理学「少数性生物学」(2015-2016) 分担者